医院污水特别是方舱医院污水其污水水质性质和生活污水差不多，不同就是污水内可能菌群超标，需要在污水处理设备末尾的消毒工艺上适当延长污水消毒时间，医院废水处理设备运行模式为全自动运行模式，可以去除污水当中的COD、BOD、氨氮、大肠杆菌等污染物。
为达到中出水水质要求，本污水处理工艺包含预处理（格栅、调节池）、二级处理（生化+MBR池）、消毒等环节。
加强处理效果的一级强化处理适用于处理出水进入二级处理城市污水处理厂的综合医院。二级处理工艺适用于传染病医院(包括带传染病房的综合医院)和排入自然水体的综合医院污水处理。
医院的污水，除一般生活污水外，还含有化学物质、放射性废水和病原体。因此，必须经过处理后才能排放，特别是肝炎等传染病病房排出来的污水，须经消毒后才可排放。
医院废水处理设备采用国际生物处理工艺，在总结国内外生活废水处理装置的运行经验的基础上，结合自己的科研成果和工程实践，设计出一种可地埋设置的成套有机废水处理装置，集去除BOD5、COD、NH3-N于一身，具有技术性能稳定可靠、处理效果好、投资省、自动化运行、维护操作方便、不占地表面积、不需盖房、不需采暖保温等优点。地面之上可种花种草，不影响周围环境。
